埔里的南港溪是埔里唯一尚未水泥化的溪流，近年來因淤積與水患問題，政府預計分三階段在南港溪流興建高達3公尺的河堤，現今第一段興建的河堤已讓附近生態改變，未來還要興建至埔里盆地最東端的出口，勢必造成環境的改變。
經過居民一年多以來的調查，附近河岸有很多的鳥種，同一時間最多有的鳥種大概有50多種，也有三種保育種，像紅尾伯勞、台灣八哥 ，這附近有出現過菱角鳥。如此多的鳥類證明，這裡場域適合這些生物棲息。此外河川內也有保育類動物，當然也有像台灣白魚、埔里中華爬岩鰍，這些都是保育類還有蝦姑、石賓還有蝦子、螃蟹。許多居住於此地的居民兒時都有到溪流戲水的回憶。
但是現今南港溪流域上游，吸納埔里鎮未經處理流出來的廢水，但經過濕地層層過濾後，會使下游的水變清澈了，生物就更多了。可見這條自然的的河川是天然的過濾器。但興建河堤後，河川就與人相隔了。我們人類的行為、人類的建設，大量的去干涉這些生物居住的場所，導致鳥類它必須搬家，就像河堤蓋下去，那翠鳥一定要先搬家。因為翠鳥習慣於河岸中鑽沙洞，水泥河岸使他們無法築朝。還有很多的一些烏龜可能爬不上去，也要搬家，如果我們能夠適當的為它們多著想，在河岸建設的過程當中多一點生態工法，多一點讓它能夠跟臨田可以接觸，讓它能重新再回歸到陸上，甚至跟陸地之間的連結能夠繼續產生。那得這種保育其實是最棒的!
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