方舟庇護商店主要販賣手搖飲與烘焙商品於110年3月收滿6位庇護員工開始營運以來，致力於庇護員工的職能強化、社會環境適應、職場體驗等教育訓練，俾使庇護員工能轉銜至一般職場就業，2年來已聘用12位身心障礙庇護員工，已有6名庇護員工在一般職場穩定就業。110年媒合2位，111年媒合4位，去年就業媒合率達67%。
111年初，方舟庇護商店在國立中山大學社會企業發展研究中心的協助下，參與了「庇護工場SORI分析及創新服務模式之研究」，統整出方舟庇護商店營利與非營利組織不同面向產出的效益。
方舟庇護商店成立二週年之際，在中山大學的引荐下，接待了馬來西亞Neoone團隊參訪與交流。Neoone團隊主要是從事社會創新的教育，進行培訓課程的設計、商業模式的課程，並與蘇格蘭的社會企業學院有合作，進行社會企業的教育推廣，課程對象包含國高中學生、大學生、社會企業等等。
方舟庇護商店成立時，即是疫情警戒期間，尤其是110年5-8月尤為慘淡。庇護商店設立在捷運站內，由於民眾擔心疫情遂避免搭乘公共運輸設備，捷運站運量縮減至一成，庇護商店一天的營業額也只有300元左右。同時期的其它庇護工場甚至有停業的。為了庇護員工的健康安全，方舟庇護商店對外的職場體驗、社會環境適應全面暫停，庇護員工全數在店內強化體適能、清潔工作訓練與職前課程講習。
方舟庇護商店是由社團法人高雄市方舟就業服務協會所設立，除了身心障礙庇護員工外，尚有中高齡、更生人、街友等特定對象在此工作，除了可以獲得薪資外，更強化工作人員的在職教育訓練。方舟就業服務協會在此投入大量專業人力與財務支出。每一個訓練、每一份支出與付出，都為了提昇員工能力後，將員工轉送到外面一般職場去就業，而非留任。
除了高雄市政府勞工局提供部份補助外，尚有民間企業水巷茶弄連鎖茶飲、開富國際食品有限公司的專業技術指導，高雄中北扶輪社、台新銀行公益慈善基金會等單位的財務、設備支持。讓方舟就業服務協會可以發揮專業，致力於職能強化訓練與就業服務的投力。
身障者20歲的小羿（化名），身材嬌小，僅有146公分、42公斤，為新住民第二代，因為往返母親母國與台灣二地居住與就學，學習歷程斷斷續續，導致中文閱讀能力較弱，在方舟庇護商店工作時，全靠記憶與背頌。小羿表示：「喜歡在方舟庇護商店工作，能學習調飲料和做麵包，而且喜歡和同事一起出去玩，之後想要去外面工作賺更多的錢，買自己想要的東西。」。
方舟庇護商店負責人王姿琦表示：「憲法第15條保障人民之工作權，弱勢民眾可能一般企業沒有聘用意願，需仰賴政府政策與非營利組織的專業介入，強化弱勢民眾的工作能力，並提昇一般企業的聘用意願，才能促使弱勢民眾獲得工作保障。」。
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